木瓜酵素是存在于木瓜中的一种蛋白质分解酵素。尤其尚未熟成的青木瓜含量大约是红木瓜的2倍。它是最好的蛋白质分解酵素，可以帮助人体分解肉类蛋白质，因此饭后食用，可以整肠助消化，有治疗肠胃炎、消化不良等疾病的效果。
木瓜酵素用于烹调中，就是我们常听到的“松肉粉”或是“嫩精”，嫩精的作用是可以将肉类的结缔组织分解，让肉吃起来更鲜嫩，所以用木瓜炖肉，肉质也会更鲜嫩。另外，木瓜酵素能帮助分解并去除肌肤表面的老废角质，所以也常应用在化妆品及保养品中。
木瓜还富含各种营养素，味道香甜多汁，而且含有多种营养素，包括维生素A、B、B1、B2、C及蛋白质、铁、钙、木瓜酵素、有机酸及高纤维等，含有的营养素之多，几乎可在众水果中称王。其中维生素A及维生素C的含量特别高，是西瓜及香蕉的五倍，其中的维他命C就有预防感冒的功能。
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